Trong quá trình hỗ trợ một doanh nghiệp thực hiện kê khai thuế sử dụng đất phi nông nghiệp đối với dự án có sử dụng đất, Công ty chúng tôi phát sinh vướng mắc như sau:

Doanh nghiệp đã nhận chuyển nhượng một phần diện tích đất ở và đã kê khai thuế sử dụng đất phi nông nghiệp đối với phần đất ở này từ năm 2021.

Đối với phần diện tích đất còn lại, năm 2022, cơ quan nhà nước có thẩm quyền ban hành quyết định cho phép chuyển mục đích sử dụng đất để thực hiện dự án. Tuy nhiên, đến tháng 12/2025, cơ quan nhà nước mới xác định xong nghĩa vụ tài chính về tiền sử dụng đất khi chuyển mục đích và doanh nghiệp đã nộp đầy đủ trong tháng 12/2025. Đến năm 2026, Sở Nông nghiệp và Môi trường mới cấp Giấy chứng nhận quyền sử dụng đất ghi nhận mục đích sử dụng đất mới.

Theo quy định về quản lý thuế, thời hạn kê khai thuế sử dụng đất phi nông nghiệp là 30 ngày kể từ ngày phát sinh nghĩa vụ thuế hoặc ngày phát sinh thay đổi các yếu tố làm thay đổi căn cứ tính thuế. Tuy nhiên, thực tế nêu trên phát sinh cách hiểu khác nhau về thời điểm kê khai đối với phần đất được chuyển mục đích.

Tôi xin hỏi: Đối với phần diện tích đất được cơ quan nhà nước cho phép chuyển mục đích sử dụng đất, doanh nghiệp phải kê khai thuế sử dụng đất phi nông nghiệp trong thời hạn 30 ngày kể từ thời điểm nào: Kể từ ngày quyết định cho phép chuyển mục đích sử dụng đất có hiệu lực; hay kể từ ngày doanh nghiệp được cấp Giấy chứng nhận quyền sử dụng đất ghi nhận mục đích sử dụng đất mới?

Trường hợp thời điểm kê khai được xác định là ngày có quyết định cho phép chuyển mục đích sử dụng đất, kính đề nghị Bộ Tài chính hướng dẫn thêm: doanh nghiệp căn cứ vào hồ sơ, tài liệu nào để kê khai khi tại thời điểm đó chưa được cấp Giấy chứng nhận ghi nhận mục đích sử dụng đất mới?